از جمله شبهات اساسی وهّابیت در موضوع مهدویت شبهه‌ی «عدم امکان طول عمر آن حضرت» است؛ ابن‌تیمیه، بنیان‌گذار فکری فرقه‌ی ضالّه‌ی وهّابیت در این شبهه‌ به روایتی از پیامبر (صلی‌الله‌علیه‌وآله) استناد کرده: «هر چه زمان بگذرد عمر انسان‌ها کمتر و کوتاه‌تر می‌شود تا این که عمر امّت من بین 60 تا 70 سال برسد.»

افراط که شاخصه اصلی در اندیشه سلفیان جهادی است، در قاعده ای به نام قاعده تکفیر کافر متجلی می‌شود. این در حالی است که برخی از جریانات سلفی خود این قاعده را قبول ندارند و معتقدند که هر کس کافری را کافر نداند حداکثر فاسق است و می‌گویند این قاعده از اجتهادات علماء است، لذا کسیکه با قاعده‌ای از قواعد علما (قواعدی اجتهادی) مخالفت کند، حتی فاسق هم نیست.

از کسانیکه در طول چند قرن، مورد توجه خاص وهابیان قرار گرفته و برای او ارزش فراوانی از نظر علمی قائلند، ابن‌تیمیه است. او کسی است که افکار وهابیان از او سرچشمه می‌گیرد. وهابیان برای او کنگره‌های علمی گرفته و کتاب‌هایی در مدح و منزلت و شخصیت علمی‌اش تألیف کرده‌اند، و برخی عالمان اهل سنت نیز بر علیه او مواضع تندی گرفته‌اند.

وهابیون که در کار جعل، تحریف و توهین به مقدسات شیعه سابقه‌ای درازمدت داشته و در بحث‌ها و گفتگوهای علمی شدیدا کم آورده، تلاش کردند که در شبکه‌های ماهواره‌ای و سایت‌های اینترنتی وابسته به خود، مادران چند تن از اهل‌بیت خصوصا مادر امام زمان را مورد اتهام قرار داده و به خاطر کنیز بودن، بدترین جسارت‌ها را به آن بزرگواران نمایند.

یکی از شبهاتی که پیروان وهابیت در موضوع مهدویت به شیعه وارد می‌کنند شبهه‌ای است که احمد امین مصری با برشمردن برخی از آثار منفی که به گمان وی برای احادیث مهدویت به وجود آمده، می‌نویسد: نظریه خرافی مهدویت، نظریه‌ای است که با سنت خداوند نمی‌سازد. که در پاسخ می‌گوییم این ادعا صحیح نیست چرا که چنین موضوعی را نمی‌توان یک نظریه پنداشت.

یکی از مباحث اختلافی در میان مسلمانان و وهابیت، توسل به دعای بزرگان دین پس از وفات ایشان است. وهابیت با صراحت و وقاحت این عمل را مشروع ندانسته و دایره آن را به پیامبر (صلی‌الله‌علیه‌وآله) سرایت می‌دهد. به همین منظور عالمان مکتب دیوبند در مقابل مبلغان وهابی موضع مخالف اتخاذ کرده و بیان ایشان را به چالش می‌کشانند.