سلام خدمت دوست عزیز. اصلا مقایسه خوبی نکردید .فقط کافی است شما آیات مربوط به همان مسجد ضرار را بخوانید کاملا متوجه می شوید که چرا پیامبر مسجد را تخریب کرد واز همه مهمتر خداوند دستور داد که در آن مسجد قیام وعبادت نکند . حد اقل به معانی آیات توجه کنید.آیات 107 الی 110 سوره توبه.گروهى ديگر از آنهاكسانى هستند كه مسجدى ساختند براى زيان (به مسلمانان)، و (تقويت) كفر، و تفرقه‏افكنى ميان مؤمنان، و كمينگاه براى كسى كه از پيش با خدا و پيامبرش مبارزه كرده بود؛ آنها سوگند ياد مى‏كنند كه: «جز نيكى و خدمت، نظرى نداشته‏ايم!» امّا خداوند گواهى می‏دهد كه آنها دروغگو هستند! (107) هرگز در آن (مسجد به عبادت نايست!) آن مسجدى كه از روز نخست بر پايه تقوا بنا شده، شايسته‏ تر است كه در آن (به عبادت) بايستى؛ در آن، مردانى هستند كه دوست مى‌‏دارند پاكيزه باشند؛ و خداوند پاكيزگان را دوست دارد! (108) آيا كسى كه شالوده آن را بر تقواى الهى و خشنودى او بنا كرده بهتر است، يا كسى كه اساس آن را بر كنار پرتگاه سستى بنا نموده كه ناگهان در آتش دوزخ فرومى‏‌ريزد؟ و خداوند گروه ستمگران را هدايت نمى‏‌كند!(109) (امّا) اين بنايى را كه آنها ساختند، همواره بصورت يك وسيله شك و ترديد، در دلهايشان باقى مى‏‌ماند؛ مگر اينكه دلهايشان پاره پاره شود (و بميرند؛ و گر نه، هرگز از دل آنها بيرون نمى‏‌رود)؛ و خداوند دانا و حكيم است! (110)