پایگاه جامع فرق، ادیان و مذاهب_  رهبران مسیحیان کشور به مناسبت رحلت شهادت گونه حجت‌الاسلام‌والمسلمین سید ابراهیم رئیسی و همراهانشان، پیام‌های تسلیتی خطاب به مقام معظم رهبری و مردم شریف ایران دادند. متن این پیام‌ها به شرح ذیل است:

«با دردی عمیق از سانحه هوایی که رئیس جمهور کشور، آیت‌الله سید ابراهیم رئیسی و هیئت همراه به شهادت رسیدند مطلع شدم. رئیس‌ جمهوری که در راه خدمت شهید شد و همانطور که قرآن می‌گوید: “کشته ‌شدگان در راه خدا را مرده ندانید، آنها زنده‌‌اند و شایسته رحمت الهی هستند”. جامعه ارامنه از صمیم قلب این فقدان عظیم را به جایگاه عظیم‌الشان رهبر انقلاب، حضرت آیت‌الله خامنه‌ای، مردم عزیز ایران و خانواده‌های شهدای حادثه سقوط بالگرد، تسلیت عرض می‌نماید. دست دعا به بارگاه حضرت حق افراشته و برای روح شهیدان، شادی و آرامش و برای خانواده‌هایشان تسلی و برای ایران عزیزمان صلح پایدار آرزومندیم.»

اسقف اعظم سیبوه سرکیسیان، خلیفه ارامنه تهران

اسقف اعظم گریگور چیفتچیان، رئیس شورای خلیفه‌گری کل ارامنه آذربایجان نیز در پیام تسلیت خود آورده است:

«شهادت جناب آقای دکتر سید ابراهیم رئیسی، رئیس جمهور محترم و مردمی جمهوری اسلامی ایران، حجت الاسلام والمسلمین جناب آقای سید محمد علی آل هاشم، نماینده محترم ولی فقیه در استان آذربایجان شرقی و امام جمعه محبوب تبریز، جناب آقای دکتر مالک رحمتی، استاندار محترم و  پر تلاش استان آذربایجان شرقی و جناب آقای دکتر امیر عبداللهیان، وزیر محترم امور خارجه کشور عزیز جمهوری اسلامی ایران که در حین خدمت صادقانه و بهره‌برداری از ثمره‌ی تلاش بی‌وقفه عزیزان در جهت نیل به اهداف مقدس جمهوری اسلامی ایران به وقوع پیوست را از طرف اسقف اعظم گریکور چیفتچیان خلیفه کل ارامنه آذربایجان، مجمع نمایندگان و شورای خلیفه‌گری کل ارامنه آذربایجان و جامعه ارامنه، این مصیبت وارده را به محضر رهبر معظم جمهوری اسلامی ایران، حضرت آیت‌الله العظمی خامنه‌ای، اعضای محترم هیئت دولت، خانواده‌ی محترم آن شهیدان و مردم غیور جمهوری اسلامی ایران تسلیت عرض نموده و از درگاه خداوند متعال علو درجات و حشر با اولیا الله و برای بازماندگان صبر جزیل مسئلت می‌نماییم.»

 دعاگو
اسقف اعظم گریگور چیفتچیان‌، خلیفه کل ارامنه آذربایجان و رئیس شورای خلیفه گری کل ارامنه آذربایجان، گاگیک جوجیان

اسقف اعظم سیپان کاشجیان در واکنش به این حادثه اندوهناک نوشتند:
«با تأسف و تألم فراوان، ضایعه شهادت خادم جمهور مردم ایران، رییس جمهور محبوب آیت‌الله دکتر سید ابراهیم رئیسی را به سوگ نشسته‌ایم. شهادت ایشان و هیأت همراه، که عناصر خدوم ملت ایران بوده‌اند غمی دوچندان برای ما و سعادتی ابدی برای ایشان است. بر ما واضح است که ملت سرفراز ایران در طول تاریخ مقاومت و انقلاب خود با توکل به خداوند بزرگ و رهبری داعیانه حضرت امام و رهبر معظم انقلاب اسلامی از بزنگاه‌های تاریخی بسیاری با سربلندی عبور نموده‌اند و این‌بار نیز با اتحاد و همبستگی دوچندان در کنار رهبری و مسئولین کشور خواهند ایستاد.
من از طرف خود، ارکان خلیفه‌گری و جامعه ارامنه اصفهان و جنوب ایران، شهادت رییس جمهور و جمعی از مقامات بلند پایه کشور را خدمت مقام معظم رهبری، حضرت آیت‌الله خامنه‌ای، خانواده این عزیزان و آحاد ملت ایران تسلیت عرض نموده، از درگاه الهی علوّ درجات برای ایشان و سربلندی ملت بزرگ ایران را خواستارم.»

اسقف اعظم سیپان کاشجیان، پیشوای مذهبی ارامنه اصفهان و جنوب ایران