دلایل کسانی که با زرتشتی بودن کورش مخالف هستند (و او را زرتشتی نمی‌دانند)، اینکه در منشور کورش از بت مردوک به عنوان خدای آسمان‌ها و زمین یاد شده است. کورش نماد از بت بعل در کاخ خود استفاده می‌کرد. وی در هیچ کتیبه ای نامی از اهورامزدا و زرتشت نیاورده است. ( همچنین وصیت‌نامه ای که از او نقل میکنند که "مرا در این خاک دفن کنید تا ..." هم زرتشتی نبودن او را ثابت میکند. مگر اینکه بگویید این وصیت جعلی و طبق معمول دروغ است).