انجمن حجّتیه مخالف تشکیل حکومت اسلامی و دخالت در سیاست بود و با استناد به روایتی، برافراشته شدن هر پرچمی را قبل از ظهور، پرچم طاغوت معرفی می‌کرد.

امام خمینی (ره) در نقد این تفکر، وجود چنین روایاتی را شامل پرچم‌های مدعیان دروغین مهدویت دانسته و روایات ممانعت از تشکیل حکومت قبل ظهور را مخالف مسلّمات دین و مذهب می‌داند.