از آسیب‌های مهم و شایع فرقه‌ها ایجاد شکاف بین اعضای خانواده‌هاست. اگر عضوی از اعضای یک خانواده به سمت فرقه‌گرایی تمایل پیدا کند، دیگر اعضای خانواده هم خواسته یا ناخواسته درگیر مشکلات و آسیب‌های ناشی از فرقه‌گرایی او خواهند شد. کما اینکه در موارد متعددی به‌خاطر آموزه‌های فرقه، بین اعضای خانواده‌ شکاف ایجاد شده و فرقه با بدبین کردن اعضاء به همدیگر، آنان را در مقابل هم قرار داده است.