ایــده‌های چوپــرا به طــور منظـم توسـط متخصصــان پـزشکـی و فیـزیک مـــورد انتقاد قرار گرفته است.
به عنـوان مثـال رابـرت کــارول می‌گوید: «تلاش چوپرا برای ادغام آیورودا با مکانیک کوانتومی، نوعی توجیه آموزه‌های خود است.»

همچنین دیگر استادان فیزیک، نظریه‌های دیپاک چوپرا را نظریه‌ی غیر علمی و گمراه کننده دانسته و به او اعتراض‌های تندی کرده‌اند. ریچارد داوکینز سخنـان او را صـدای حُقّـه و گمراه‌کننده می‌داند و دیوید گورسکی او را شارلاتان می‌خواند.